Antes de continuar con el siguiente paso, asegúrese de conocer el funcionamiento de la fuente de poder y cuba. Bajo ninguna circunstancia toque ni abra la cuba mientras está conectada a la red eléctrica. Luego de finalizada la corrida y desconectada fuente de poder, se recomienda esperar un par de minutos para permitir la disipación de eventual corriente estática
Correr bajo un amperaje constante de 3 mA por cada tira de 2,5x17 cm o proporcionalmente para tiras mas anchas.
Aplicar un Voltaje constante de entre 150 V/ 30ª 60 minutos hasta 200 V /22 minutos (1-1,5 mA/cm). Es decir, aproximadamente 3-4 mA por cada tira de 2,5*17).
Cada laboratorio debe determinar las condiciones óptimas de corrida de acuerdo a su equipamiento (fuentes, cuba, electrodos, etc.).
Se recomienda no reutilizar el Buffer, pero en caso de hacerlo mezclar previamente los depósitos aniónico y catiónico, ya que el pH de cada uno será diferente luego de la corrida.